Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement (MaIAGE)

Présentation du laboratoire

L'unité de recherche MaIAGE regroupe des mathématiciens, des informaticiens, des bioinformaticiens et des biologistes autour de questions de biologie et agro-écologie, allant de l'échelle moléculaire à l'échelle du paysage en passant par l'étude de l'individu, de populations ou d'écosystèmes. L'unité développe des méthodes mathématiques et informatiques motivées par des problèmes biologiques précis. Elle s'implique aussi dans la mise à disposition de bases de données et de logiciels permettant aux biologistes d'utiliser les outils dans de bonnes conditions ou d'exploiter automatiquement la littérature scientifique.
L'inférence statistique et la modélisation dynamique sont des compétences fortes de l'unité, auxquelles s'ajoutent la bioinformatique, l'automatique et l'algorithmique. Les activités de recherche et d'ingénierie s'appuient également sur une forte implication dans les disciplines destinatrices : écologie, environnement, biologie moléculaire et biologie des systèmes.

Les 20 dernières publications

Titre Auteurs Date de publication Source
Clarification on the implementation of the Nagoya Protocol in France for the access and sharing of benefits arising from the utilization of microbial genetic resources Michel Yves Mistou 01/03/2024 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Optimal enzyme profiles in unbranched metabolic pathways Wolfram Liebermeister 09/02/2024 Interface Focus
The ocular mathematical virtual simulator: A validated multiscale model for hemodynamics and biomechanics in the human eye Lorenzo Sala 01/02/2024 International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering
Model-based clustering of multiple networks with a hierarchical algorithm Tabea Rebafka 01/02/2024 Statistics and Computing
Bayesian high-dimensional covariate selection in non-linear mixed-effects models using the SAEM algorithm Renaud Rincent 01/02/2024 Statistics and Computing
Insight into the Role of Gut Microbiota in Duchenne Muscular Dystrophy: An Age-Related Study in Mdx Mice Mahendra Mariadassou, Olivier Rué 01/02/2024 American Journal of Pathology
Multi-omics data integration for the identification of biomarkers for bull fertility Valentin Costes, Eli Sellem, Aurélie Bonnet, Hélène Kiefer 01/02/2024 PLoS ONE
Two level natural selection with a quasi-stationarity approach Aurélien Velleret 01/02/2024 Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B
Sex-specific transcriptome of the chicken chorioallantoic membrane Christelle Hennequet-Antier 01/01/2024 Genomics
neo4jsbml: import systems biology markup language data into the graph database Neo4j Sandra Dérozier 01/01/2024 PeerJ
A neural-mechanistic hybrid approach improving the predictive power of genome-scale metabolic models Wolfram Liebermeister 01/12/2023 Nature Communications
Direct comparison of spatial transcriptional heterogeneity across diverse Bacillus subtilis biofilm communities P. Nicolas, Sandra Dérozier 01/12/2023 Nature Communications
Cooperative cell–cell actin network remodeling to perform Gap junction endocytosis Alain Trubuil 01/12/2023 Basic and Clinical Andrology
An analysis of entity normalization evaluation biases in specialized domains Arnaud Ferré 01/12/2023 BMC Bioinformatics
A successive time-to-event model of phyllochron dynamics for hypothesis testing: application to the analysis of genetic and environmental effects in maize Elodie Marchadier, Adrienne Ressayre, Christine Dillmann 01/12/2023 Plant Methods
TreeJ: an ImageJ plugin for interactive cell lineage reconstruction from static images Elise Laruelle, Alain Trubuil 01/12/2023 Plant Methods
Thermal conditioning of quail embryos has transgenerational and reversible long-term effects Christelle Hennequet-Antier 01/12/2023 Journal of Animal Science and Biotechnology
Four functional profiles for fibre and mucin metabolism in the human gut microbiome Simon Labarthe, Sandra Plancade, Sebastien Raguideau, Beatrice Laroche 01/12/2023 Microbiome
Data-Driven Score-Based Models for Generating Stable Structures with Adaptive Crystal Cells Tabea Rebafka 27/11/2023 Journal of Chemical Information and Modeling
Stochastic models of regulation of transcription in biological cells Vincent Fromion 01/11/2023 Journal of Mathematical Biology

Nombre de publications du laboratoire par domaine scientifique (2016-2021)

Chaque publication du laboratoire peut être rangée dans une ou plusieurs disciplines scientifiques : la figure ci-dessus présente le nombre de publications du laboratoire pour chaque discipline de la classification ASJC (Elsevier)