M2 Biologie, Physiologie, Pharmacologie de la respiration et du sommeil

Maîtrise de la langue anglaise

Compétences visées :
- Compétences à la présentation orale et à l'expression orale en anglais dans un contexte scientifique

Contenu de l'UE/ECUE :
- L'étudiant effectue une présentation orale en anglais. Il est évalué sur sa maîtrise de la langue.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Méthodologie de la recherche bibliographique, de la construction d'un projet de recherche, du maniement d'un outil de présentation (type Office ppt)

Compétences visées :
- Recherche bibliographique, analyse de la littérature : maîtrise bibliographique du projet
- Elaboration d'un projet de recherche sous la direction d'un(e) HDR, : maîtrise scientifique du porjet
Présentation projet de recherche : savoir présenter (esprit de synthèse, qualité d'expression orale, qualité du support …)

Contenu de l'UE/ECUE :
- Préparation du projet de recherche. L'étudiant présente oralement son projet de recherche et ses résultats préliminaires.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Cette UE est dédiée aux rappels essentiels en matière de techniques de biologie cellulaire et moléculaires appliquées au cancer. Les grandes voies de signalisation impliquées dans les mécanismes de transformation sont rappelés (p53, K-RAS/EGFR, RASSF1A, c-met) ainsi que les grands mécanismes impliqués: contrôle du cycle cellulaire, contrôle des différents types de mort cellulaire, épigénétique par ARN non codants, migration et invasion, angiogenèse, immunité anti-tumorale, différenciation épithélio-mesenchymateuse, cellules souches... Les approches méthodologiques et technologiques les plus récentes sont présentées (xenogreffes, transgenèse, séquençage massivement parallèle) et les analogies entre le développement embryonnaire du tissu respiratoire et les mécanismes de cancérisation sont présentés.

Compétences visées :
Connaissances des dernières avancées en matière de grands mécanismes de cancérisation respiratoire et compréhension des méthodologies d'étude de ces mécanismes. Ces connaissances biologiques doivent être mobilisées pour la compréhension des mécanismes d'action des nouveaux traitements biologiques ciblés, des immunothérapies de cancers broncho-pulmonaires et de leurs mécanismes de résistance. L'analogie entre les mécanismes physiologiques de développement et différenciation des tissus respiratoires et les mécanismes de cancérisation est soulignée en permanence et doit être comprise à l'issue de cet enseignement.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Cette UE permet d'étudier au niveau biochimique et moléculaire le fonctionnement et les dysfonctionnements des épithéliums respiratoires. Elle analyse les interactions de ces épithéliums avec leur environnement cellulaire et leurs réponses aux agressions ou à des phénomènes pathologiques.

Compétence visées :
- Connaissances des dernières avancées dans les champs la recherche biologique et physiologiques des domaines concernés.
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents travaux

Contenu de l'UE/ECUE :
- Physiologie de l'épithélium alvéolaire, interaction des cellules épithéliales alvéolaires et des cellules mésenchymateuses
- Physiopathologie des anomalies du surfatant et du syndrome de détresse respiratoire aiguë
- Epithélium des voies aériennes: rôle dans l'immunité innée, rôle du NO
- La protéine CFTR dans les voies aériennes et sa pathologie
- Sénescence des cellules respiratoires
- Effets des particules atmosphériques sur l'épithélium respiratoire
- Analyse d'articles.

Octobre - Novembre - Décembre.

Université Paris 13

Connaitre :
- Rythmes circadiens
- Les mécanismes cellulaires et moléculaires de la régulation chronobiologique
- La physiopathologie et la clinique des insomnies
- Neurobiologie et imagerie de l'insomnie
- Sommeil en conditions de vie extrêmes, adaptations et physiopathologie

Compétence visées :
- Acquisition des savoirs les plus récents dans les champs décrits de physiologie du sommeil et de la vigilance
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents enseignements

Contenu de l'UE/ECUE :
Génétique de l'horloge, neurobiologie chronobiologique, décalage de phase, modèles en libres cours, processus endocriniens et horloge, rêve et sommeil, insomnie épidémiologie définitions, modèles de l'insomnie psychophysiologique, insomnies comorbides, sommeil en conditions extrêmes.

Octobre - Novembre - Décembre.

Cette UE a pour objectif de décrire l'anatomie, la physiologie et la biologie de la circulation pulmonaire normale et pathologique. Les dysfonctionnements des vaisseaux pulmonaires et leurs conséquences cardiaques droites seront décrites à partir de données expérimentales et humaines. Les anomalies biologiques et leurs traitements ciblés seront analysées.

Compétences visées :
- Connaissances des dernières avancées dans le domaine.
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents travaux.

Contenu de l'UE/ECUE :
- Anatomie et physiologie de la circulation pulmonaire et bronchique normale et pathologique
- Exploration hémodynamique pulmonaire normale et pathologique au repos et à l'effort
- Explorations fonctionnelles à l'effort au cours des hypertensions pulmonaires
- Classification des hypertensions pulmonaires
- Génétique des hypertensions pulmonaires héritables
- HTAP médicamenteuses, drépanocytaires et hypoxiques
- Dysfonction ventriculaire droite dans l'hypertension pulmonaire post-embolique humaine et expérimentale
- Caractéristiques cliniques, hémodynamiques, histologiques et fonctionnelles de la maladie veino-occlusive
- Dysfonction endothéliale pulmonaire et désordres du système inflammatoire
- Les mécanismes physiopathologiques contribuant au remodelage de la circulation pulmonaire
- Autoimmunité et inflammation au cours de l'hypertension artérielle pulmonaire.

Octobre - Novembre - Décembre.

KREMLIN-BICETRE

Cette UE a une orientation essentiellement moléculaire et cellulaire. Elle a comme objectifs principaux de :
- Rappeler les grandes techniques d'analyse (génomique, protéomique) et de modification de l'expression génique (KO, transgenèse, siRNA)
- Présenter l'immunologie et l'immuno-pathologie respiratoires
- Etudier le remodelage tissulaire dans les grandes pathologies respiratoires, notamment les processus de fibrogenèse

Compétences visées :
- Connaissances des dernières avancées dans les champs la recherche biologique et physiologiques des domaines concernés.
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents travaux.

Contenu de l'UE/ECUE :
- Cellules souches respiratoires
- Développement pulmonaire
- Physiopathologie des maladies bronchiques (asthme, BPCO, ciliopathies …) et mécanismes du remodelage bronchique
- Physiopathologie des pathologies pulmonaires fibrosantes (fibrose pulmonaire, granulomatoses …)
- Analyses d'articles.

Octobre - Novembre - Décembre.

Université Paris 13

Connaître :
- la neurobiologie des états de veille et de sommeil,
- la régulation homéostasique et chronobiologique,
- la classification internationale des pathologies du sommeil
- les méthodes d'exploration y compris les nouveaux outils (analyse automatique, IA …)
- les régulations endocriniennes au cours du sommeil
- phylogenèse et ontogenèse du sommeil

Compétence visées :
- Acquisition des savoirs les plus récents dans les champs décrits de physiologie du sommeil et de la vigilance
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents enseignements

Contenu de l'UE/ECUE :
Ontogénèse et phylogénèse du sommeil, fonctions du sommeil, règles de scorage, neurobiologie des états de veille et de sommeil, régulations circadiennes et homéostatiques.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Connaissances des dernières avancées dans les champs la recherche biologique physiologique et physiopathologique en neurobiologie et neurophysiologie du sommeil et des adaptations cardiorespiratoires au cours du sommeil.

Compétences visées :
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents travaux

Contenu de l'UE/ECUE :
- Cette UE s'organise en deux parties. La première partie est dévolue plus spécifiquement à la neurophysiologie respiratoire : bases fondamentales de la rythmogenèse ventilatoire, plasticité et adaptabilité du contrôle ventilatoire, contrôle ventilatoire de l'enfant de l'adulte et les modèles animaux. La deuxième partie est orientée vers la physiologie et la physiopathologie du sommeil et ses liens avec la respiration (bases fondamentales électrophysiologiques et neurobiologiques, commande ventilatoire et des muscles respiratoire au cours du sommeil, régulation végétative et cardiovasculaire au cours du sommeil, troubles respiratoires du sommeil, effets de l'hypoxie chronique et intermittente.
- Analyses d'articles.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Cette UE a pour objectif d'enseigner la pharmacologie des grands médicaments du système respiratoire. Elle aborde les modèles expérimentaux, le développement pré-clinique et clinique dans les principales pathologies concernées, les cibles thérapeutiques d'intérêt ainsi que les mécanismes d'action des grandes familles de médicaments (bronchodilatateurs, anti-inflammatoires…).

Compétences visées :
- Connaissance des modalités de développement de nouveaux médicaments du système respiratoire ;
- Maîtrise de la pharmacologie des médicaments actuels.
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents enseignements

Contenu de l'UE/ECUE :
Pharmacologie des agonistes ?2-adrénergiques, des glucocorticoïdes, des anti-cytokines et du système cholinergique ; pharmacométrie ; développement clinique dans l'asthme et la BCPO ; modèles expérimentaux et approches physiopathologiques de l'HTAP ; rôle du NO et donneurs de NO/CO ; pharmacologie de la protéine CFTR ; transfert de gènes et thérapie des muscles respiratoires ; mastocytes dans les maladies pulmonaires et bronchiques ; les Toll-like receptors dans les maladies respiratoires ; physiopathologie et modèles animaux dans la fibrose pulmonaire ; pharmacologie et toxicologie des nanoparticules dans les voies aériennes ; phénotypes du macrophage et inflammation pulmonaire.

Octobre - Novembre - Décembre.

Université Paris Est Créteil

Cette UE est dédiée à l'intégration des données de la physiologie d'organe, appliquée au système respiratoire dans son ensemble. La modélisation mathématique et son interface avec la biologie et la physiologie en représentent une part importante. Un exemple d'application à la pathologie est la modélisation des voies aériennes, la relation structure-fonction et l'imagerie des relations structure-fonction dans les pathologies respiratoires obstructives.

Compétences visées :
- Connaissances des dernières avancées dans les champs la recherche biologique et physiologiques des domaines concernés.
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents travaux.

Contenu de l'UE/ECUE :
Introduction à la Biomécanique Cellulaire - Principes de mécanique ventilatoire et des échanges gazeux - Les muscles ventilatoires - Interactions cœur/poumon - Adaptation Physiologique à l'exercice - Physiopathologie du réentrainement à l'exercice - Physiologie de la ventilation mécanique - Stress mécanique et SDRA - Les méthodes d'évaluation des voies aériennes - Modélisation des voies aériennes / relation structure/fonction - Imageries des relations structure/fonction dans les pathologies respiratoires obstructives - Exemples de modèles appliqués à la Physiologie Respiratoire - Exemple de physiologie intégrée : physiopathologie des dyspnées.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Connaissances des dernières avancées dans les champs la recherche biologique physiologique et physiopathologique en neurobiologie et neurophysiologie du sommeil et des adaptations cardiorespiratoires au cours du sommeil.

Compétences visées :
- Capacité de synthèse et mise en perspective des différents travaux

Contenu de l'UE/ECUE :
- Cette UE s'organise en deux parties. La première partie est dévolue plus spécifiquement à la neurophysiologie respiratoire : bases fondamentales de la rythmogenèse ventilatoire, plasticité et adaptabilité du contrôle ventilatoire, contrôle ventilatoire de l'enfant de l'adulte et les modèles animaux. La deuxième partie est orientée vers la physiologie et la physiopathologie du sommeil et ses liens avec la respiration (bases fondamentales électrophysiologiques et neurobiologiques, commande ventilatoire et des muscles respiratoire au cours du sommeil, régulation végétative et cardiovasculaire au cours du sommeil, troubles respiratoires du sommeil, effets de l'hypoxie chronique et intermittente.
- Analyses d'articles.

Octobre - Novembre - Décembre.

PARIS

Dans le domaine du sujet de recherche
- Connaître l'état de l'art
- Acquérir les connaissances expérimentales nécessaires à la conduite du projet
- Connaitre le cadre légal de la conduite du projet de recherche (éthique CPP ou animale, CNIL si applicable etc..)

Compétences visées :
- Formuler une hypothèse, définir et mettre en œuvre les méthodes expérimentales pour tester l'hypothèse, analyse critique des résultats et mise en perspective avec la littérature, rédaction d'un mémoire exposant le travail de recherche, présentation orale du travail

Contenu de l'UE/ECUE :
- Conduite du projet de recherche dans toutes ses dimensions : élaboration d'un/de modèle(s), réalisation des expérimentations (qui peuvent être in silico, in vitro, ex vivo, in vivo, chez l'animal et chez l'homme), y compris l'analyse statistique, mise en forme des résultats en vue de leur présentation sous forme orale, communication affichée et sous forme d'article à visée de revue peer-review.

Septembre - Janvier - Février - Mars - Avril - Mai.

PARIS