16ème Rendez-Vous BioAnalyse de Paris Saclay : Xavier Raffoux : Expression différentielle des gènes dans la transition florale chez le Maïs

Chercheurs, ingénieurs, étudiants, enseignants, que vous soyez rattachés à une entité publique, à une entreprise (grand groupe, PME, StartUp) ou à une association, venez partager et échanger de manière conviviale autour d’une présentation scientifique dans le domaine de l’analyse des résultats expérimentaux en biologie.
Que vous soyez biologiste, bioanalyste, bioinformaticien, statisticien, spécialiste du machine learning, mathématicien, physicien, etc, n'hésitez pas à venir échanger, l'interdisciplinarité est toujours un atout.
Pour s'inscrire : https://www.meetup.com/fr-FR/groupe-meetup-paris-saclay-bioanalyse/. Si vous ne connaissez pas Meetup, suivez ce lien qui vous aidera.

Ce jeudi 20 avril de 12h30 à 14h30, Xavier Raffoux, Ingénieur d'étude à l'INRAE de Gif sur Yvette, nous présentera comment il étudie l'expression différentielle des gènes impliqués dans la transition florale chez le Maïs : cela permettra d'échanger sur les différentes approches que nous avons forcément les uns les autres dans ce domaine.
Dans le cadre d’une des tâches du projet « Itemaize » (https://www6.inrae.fr/basc/Recherche/Projets-phares-Phase-2016-2019/Itemaize) qui vise à étudier les caractères cibles de la sélection pour la date de floraison chez le maïs, il présentera son travail d’analyse de données de RNAseq provenant de deux génotypes de maïs (séquençage illumina de 48 échantillons d’ARN).
Ces deux génotypes sont issus d’une expérience de sélection divergente sur la précocité de floraison, expérience conduite depuis plus de 20 ans dans mon unité. Chaque année, des plantes sont ainsi sélectionnées sur la base de leur date de floraison, pour former la génération suivante.
L’objectif est d’étudier le niveau d’expression génique dans les méristèmes de plantes de ces deux génotypes (précoce – tardif), prélevés à la génération 18 et à différents stades de développement.
Il est ainsi possible de détecter les gènes différentiellement exprimés entre génotype précoce et tardif, entre stade de développement, et d’étudier les interactions entre ces deux facteurs. Les gènes détectés sont potentiellement impliqués dans la transition florale, caractère d’intérêt agronomique majeur dans le contexte de changement climatique. Plus en aval, l’étude de la réponse à la sélection au cours de cette expérience et des différents parcours évolutifs suivis nous renseignera sur les processus évolutifs mis en jeu dans le cadre de l’adaptation à un nouvel environnement.

Comme d'habitude, cette présentation sera l'occasion de faire connaissance et d'échanger ensemble autour d'un repas.
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En juin 2021, ISOFT, PME du territoire Paris-Saclay, et l’Université Paris-Saclay se sont associées pour organiser ces Rendez-Vous mensuels sur le thème de la bioanalyse, ouverts à toutes et tous, libres d’accès, dans le but qu’en nous connaissant mieux, nous participions à rendre vivante la science pratiquée sur le plateau : sur un thème à chaque fois différent en bioanalyse, la courte présentation scientifique qui initie chaque Rendez-Vous déclenche des échanges entre pairs prolongés d’un déjeuner frugal réunissant toutes les personnes intéressées et disponibles ce jour-là : académiques, entreprises, étudiants, etc.

Les échanges y sont ouverts et portent sur des sujets très variés. Ils restent à un niveau pré-compétitif et non commercial, sans échanges d’informations propriétaires ni promotions de produits ou solutions. Les créneaux choisis (en général, les 3èmes jeudis du mois entre 12h30 et 14h30) sont faits pour limiter les contraintes d’emploi du temps professionnel : chacun vient à l’occasion discuter quand il est disponible, en toute liberté.

Les Rendez-Vous précédents, où nous avons parlé de sujets aussi variés que la Multi-Omique, le métabolome, le volatolome, les approches Single-Cell en images multiplexées ou non, les transposons, les méthodologies d'analyse ou la mise en production d'outils ciblés pour permettre aux biologistes de se focaliser sur leur métier, ou encore de l'aventure que représnete la conception d'un médicament, en partant de résultatsde recherche fondamentale jusqu'à tous les niveaux de recherche clinique nécessaires, ont été très animés et ont permis aux participants de découvrir de nouveaux interlocuteurs, de confronter leurs problématiques et même déjà de montrer comment ces rencontres ouvertes ont permis de démarrer de nouvelles collaborations! Depuis un peu moins d'un an, les Rendez-Vous BioAnalyse montrent que ce nouveau format a un fort potentiel de création de rencontres inattendues et enrichissantes, qui permettent effectivement d'envisager d’éventuelles collaborations futures, pour la satisfaction de faire avancer ensemble un sujet qui nous tient à coeur.

Nous avons généralement une visibilité de 4-6 mois pour les prochains Rendez-Vous, et le rythme d’un Rendez-Vous par mois avec 10 à 20 participants à chaque fois, est une bonne solution pour permettre de venir assez souvent, ne pas être trop nombreux, et découvrir à chaque fois de nouvelles personnes

• 12h30-13h00 : introduction et tour de table
• 13h00-13h30 : un membre présente sa problématique, ses avancées, réflexions et questions
• 13h30-14h30 : discussions sur les points présentés autour d’un repas partagé
• N’hésitez pas à nous proposer des interventions !

Inscrivez-vous sur : https://www.meetup.com/fr-FR/groupe-meetup-paris-saclay-bioanalyse/
Notre but n'est pas d'échanger sur les réseaux, les Rendez-Vous en présentiel sont essentiels pour bien nous connaître, cependant, vous pouvez accéder à des résumés (surement partiaux car rédigés rapidement par une personne) ici.

Point important : Les échanges sont libres, il n’est pas autorisé d’y faire du prosélytisme, démarchage commercial etc. de même les présentations et les échanges sont ouverts (sans revendication de propriété intellectuelle sur les propos échangés). Ce point est essentiel afin de favoriser la fertilisation des réflexions grâce à des dialogues directs et réciproques.